综合业务科
承担报关单修撤、人工报关单审核、税款担保、现场验估、退补税、滞报金及滞纳金的征收和减免、直接退运、查验异常处置等工作;实施单证审核和开展未抽中货物的合格评定工作;承担业务统计、理单和档案管理、原产地证书制证发放及归档等工作;承担检验检疫证书打印和分发工作;承担风险防控、业务运行监控及综合协调工作;承担知识产权海关保护相关工作;承担法治建设工作;承担重大行政决策的合法性审查;承担行政复议、行政应诉工作;办理行政许可及检验检疫行政处罚案件;承担普法、法治宣传工作;承担减免税工作。
企业管理科
承担本辖区企业资质管理、企业信用管理工作;承担加工贸易等保税业务管理;承担保税仓库监管。
稽查科
承担海关稽查、核查、贸易调查、市场调查;承担对进入国内市场商品的抽查、进出口商品安全问题追溯调查、对企业遵守检验检疫法规状况的检查等。
查检科
承担进出境货物(物品)的海关检查、检验、检疫的实施工作;承担指定监管场地管理工作;承担检验检疫证书专业审签工作。
上合示范区监管科
承担上合示范区海关工作的综合统筹协调、政策指导服务、日常运维保障等事项;承担多式联运中心监管工作;承担海关监管场所管理工作;承担安全生产和口岸反恐工作;承担技术贸易措施研究和进口商品风险监测点相关工作;承担三级监控指挥中心管理工作;组织实施复查复验工作。
跨境电商监管科
承担胶州海关辖区跨境电商审核、检查、检验、检疫、征税、放行、退运等工作。