高通量测序的结果怎么计算覆盖率
创始人
2025-07-18 21:08:02
高通量测序的结果怎么计算覆盖率
覆盖度是指测序产出的数据覆盖到目标基因组上的比例,与测序深度相关。以人类基因组测序为例:测序深度=reads数×片段大小(bp)/3000****00。如果文库片段是100bp,产出500w的reads,那么其测序深度是0.167×,覆盖度是16.7%。在1×测序深度以内,覆盖度与测序深度呈正相关的比例,当测序深度达到一定程度时覆盖度并没有显著提高。同样以人类基因组为例:1×测序深度其覆盖度是63.21%,2×测序深度其覆盖度是87.46%,5×测序深度其覆盖度是99.3%,10×测序深度其覆盖度是99.99%

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